Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SYCNQ0VAF6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms