Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms