Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCA2P51531 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms