Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCP25054 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APCP25054 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
APCP25054 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
APCP25054 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APCP25054 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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