Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB1P20618 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB1P20618 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB1P20618 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms