Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms