Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHGAP10645 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms