Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPLO60437 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPLO60437 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPLO60437 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms