Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPAG9O60271 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms