Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1GO43497 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms