Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms