Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX6Q9UPM6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms