Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms