Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms