Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms