Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms