Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPATA9Q9BWV2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms