Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms