Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SH3GL3Q99963 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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