Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms