Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms