Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms