Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIP3Q96DZ5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms