Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC21AQ8NDW8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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