Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPAP2Q8IXW5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms