Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP4Q86YS3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms