Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF554Q86TJ5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms