Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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USP34Q70CQ2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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USP34Q70CQ2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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USP34Q70CQ2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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USP34Q70CQ2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP34Q70CQ2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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