Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms