Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDB1Q16531 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDB1Q16531 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB1Q16531 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB1Q16531 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDB1Q16531 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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