Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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