Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
R3HDM1Q15032 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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