Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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