Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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