Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN3Q13064 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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