Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms