Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB1AP62820 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms