Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms