Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIPAP38571 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms