Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD10P28358 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms