Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHP20396 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHP20396 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHP20396 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRHP20396 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRHP20396 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHP20396 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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