Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI3P10071 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI3P10071 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GLI3P10071 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GLI3P10071 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI3P10071 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI3P10071 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI3P10071 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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