Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms