Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN9O95484 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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CLDN9O95484 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN9O95484 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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