Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCA5O60264 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms