Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNMO15061 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNMO15061 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms