Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms