Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms