Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9Q9P2J2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms