Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms